我校農學院楊建敏教授團隊在四倍體長牡蠣（Crassostrea gigas）全基因組選擇育種方面取得重要進展。
研究團隊構建了遺傳穩定的四倍體長牡蠣育種群體，在此基礎上首次對其進行了重測序和全基因組選擇分析，從分子水平上鑒定到多個優良育種性狀，為四倍體長牡蠣的良種選育和三倍體長牡蠣產業化應用夯實了基礎。相關技術已授權發明專利“一種基于深度學習的四倍體牡蠣全基因組SNP分型方法”（專利號：ZL202410103260.5），相關成果發表在國際水產類權威期刊《Aquaculture》上，王衛軍教授為論文的第一作者，包曉凱為共同第一作者，楊建敏教授為通訊作者。
全基因組選擇育種通過鑒定SNP變異位點，從分子層面鑒別種質優良的個體，是構建優良核心群體和縮短良種選育周期的重要方法。該研究對四倍體長牡蠣進行重測序，鑒定到45K高質量SNP位點，并應用于全基因組選擇分析，挖掘到適合四倍體長牡蠣選育的生長性狀；構建了四倍體長牡蠣基因分型技術，以及最佳的分子育種模型。研究結果表明：四倍體長牡蠣殼高、殼長和殼寬與體重和軟體重呈正相關且達到極顯著水平；加性模型是四倍體長牡蠣的編碼模型，在估計遺傳力和育種值的準確性中具有明顯的優勢；從五種遺傳評估模型中篩選確定GBLUP是四倍體長牡蠣育種值估計的最佳模型；體重和軟體重是四倍體長牡蠣選育的理想性狀，其遺傳力和育種值估計準確率均明顯高于其它生長性狀；10K高質量SNP即可較準確估計性狀的育種值。
長牡蠣是我國北方產量最高的經濟貝類，三倍體長牡蠣在遼寧和山東沿海廣泛養殖，其產業化應用在相當程度上解決了繁殖季節出肉率低、品質差、供給斷檔和產業效益低下等問題，而通過四倍體和二倍體牡蠣間“倍性雜交”是穩定獲得三倍體牡蠣群體的最佳方法。目前，團隊已經開展了多代四倍體長牡蠣新品系選育，在生長和糖原含量方面取得了很好的表型進展和遺傳進展。四倍體長牡蠣基因分型技術和全基因組選擇育種技術的突破，對選育具有優良性狀的四倍體長牡蠣提供理論支撐，為優質三倍體牡蠣的培育提供解決方案，對長牡蠣種業的健康可持續發展至關重要。
本研究成果得到國家現代農業（貝類）產業技術體系崗位科學家項目（CARS-49）、國家自然科學基金（32072976）和山東省農業（貝類）良種工程重大項目（2020LZGC016）的資助。（農學院 通訊員：王衛軍）
