我校計算機與人工智能學院碩士研究生劉峻江作為第一作者在人工智能領域中科院SCI二區、Top期刊《Applied Soft Computing》上發表題為“Parallel convolutional and Transformer encoder method for cancer related T cell receptor sequences prediction”的學術論文,其導師周樹森副教授為通訊作者。
首先,該研究使用詞向量來表示受體序列中的氨基酸,與其他方法相比,這增強了特征提取的能力。在模型方面,采用不同注意力頭的并聯Transformer編碼器捕獲多維TCR-seq特征,與CNN的融合進一步加強了特征提取能。其次,該研究從TCR-seq中去除不必要的氨基酸,并通過將序列填充到統一長度來解決數據集利用率低的問題。最后,通過對所提出方法的可解釋性分析,該研究發現谷氨酸、脯氨酸和酪氨酸在識別癌癥相關的TCR-seq中發揮了關鍵作用,這對后續研究者探索受體的免疫機制具有重要意義。(計算機與人工智能學院 通訊員:周樹森)
